根系分析仪可以用于分析测量根的总数量、根尖数量、根总长、根平均直径、根总体积、分叉点等相关指标，还可对颜色进行分析，功能好，满足多种研究需求。
扫描式根系分析仪通过扫描获取植物根系图像进行分析测量，可分析测量根的总数量、根尖数量、根总长、根平均直径、根总体积、分叉点等相关指标，还可对颜色进行分析，满足多种研究需求，广泛适用于根系形态学、构造研究、植物科学研究等，解决根系结构和几何参数难以获取的问题。
根系分析仪按成像方式不同，可分为对原位根系图像的分析仪，以及对洗根后的根系图像分析仪。一般都要求可分析根系的长度、直径、面积、体积、根尖数、分叉数、根交叉数等。专业些的根系分析系统，还可分析植物根系的主侧根拓扑形态关系、连接关系，以及根尖部位的色彩变化，以便进行根系形态和构造研究。新的根系分析系统应具备大批量图像的全自动分析特性，用户可对自动分析结果进行局部的交互编辑修正，以确保数据的科学性。
植物根系图像分析仪的应用范围广泛。在植物学领域，它可以用于研究植物根系的形态、结构和生长规律，以及植物对环境因素的响应。在农业领域，它可以用于评估不同品种植物的根系发育情况，以及不同土壤条件下植物的生长状况。在生态学领域，它可以用于研究植物根系对土壤水分、养分和温度等环境因素的响应，以及植物根系对土壤侵蚀和水土流失的影响。
分析根系有利于植物根形态、结构的研究，也有利于农业生产的指导。应用根系分析仪可以简便、快速、准确的分析根系的各直径段长度、投影面积、表面积、体积等，以及根系的分布参数。
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